MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus equi subsp. zooepidemicus ATCC 35246 chromosome

Total Repeats: 37447

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017582	T	6	6	77	82	0 %	100 %	0 %	0 %	414562957
2	NC_017582	AGCT	2	8	98	105	25 %	25 %	25 %	25 %	414562957
3	NC_017582	T	6	6	136	141	0 %	100 %	0 %	0 %	414562957
4	NC_017582	ATG	2	6	146	151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414562957
5	NC_017582	CAA	2	6	182	187	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414562957
6	NC_017582	T	7	7	188	194	0 %	100 %	0 %	0 %	414562957
7	NC_017582	A	7	7	221	227	100 %	0 %	0 %	0 %	414562957
8	NC_017582	CAG	2	6	248	253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414562957
9	NC_017582	TGA	2	6	308	313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414562957
10	NC_017582	ACAGT	2	10	373	382	40 %	20 %	20 %	20 %	414562957
11	NC_017582	TGA	2	6	426	431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414562957
12	NC_017582	TGC	2	6	447	452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414562957
13	NC_017582	AAC	2	6	480	485	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414562957
14	NC_017582	TTTA	2	8	495	502	25 %	75 %	0 %	0 %	414562957
15	NC_017582	TTA	2	6	611	616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414562957
16	NC_017582	TGT	2	6	624	629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414562957
17	NC_017582	TCC	2	6	686	691	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	414562957
18	NC_017582	TGA	2	6	696	701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414562957
19	NC_017582	A	7	7	718	724	100 %	0 %	0 %	0 %	414562957
20	NC_017582	ATAACA	2	12	773	784	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	414562957
21	NC_017582	AGA	2	6	834	839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414562957
22	NC_017582	AGC	2	6	1077	1082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414562957
23	NC_017582	GAA	2	6	1138	1143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414562957
24	NC_017582	CA	3	6	1206	1211	50 %	0 %	0 %	50 %	414562957
25	NC_017582	TGCT	2	8	1220	1227	0 %	50 %	25 %	25 %	414562957
26	NC_017582	GGA	2	6	1297	1302	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	414562957
27	NC_017582	AATTGA	2	12	1374	1385	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	414562957
28	NC_017582	TTCA	2	8	1597	1604	25 %	50 %	0 %	25 %	414562958
29	NC_017582	CAG	2	6	1632	1637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414562958
30	NC_017582	TTG	2	6	1765	1770	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414562958
31	NC_017582	T	6	6	1807	1812	0 %	100 %	0 %	0 %	414562958
32	NC_017582	AGT	2	6	1875	1880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414562958
33	NC_017582	TGC	2	6	2019	2024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414562958
34	NC_017582	GTC	2	6	2039	2044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414562958
35	NC_017582	GA	3	6	2190	2195	50 %	0 %	50 %	0 %	414562958
36	NC_017582	GAT	2	6	2215	2220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414562958
37	NC_017582	TGA	2	6	2333	2338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414562958
38	NC_017582	AC	3	6	2366	2371	50 %	0 %	0 %	50 %	414562958
39	NC_017582	GTG	2	6	2515	2520	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414562958
40	NC_017582	GAT	2	6	2653	2658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414562958
41	NC_017582	AG	3	6	2661	2666	50 %	0 %	50 %	0 %	414562958
42	NC_017582	TGAAA	2	10	2804	2813	60 %	20 %	20 %	0 %	414562959
43	NC_017582	A	6	6	2846	2851	100 %	0 %	0 %	0 %	414562959
44	NC_017582	GTC	2	6	2932	2937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414562959
45	NC_017582	GAA	2	6	2957	2962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414562959
46	NC_017582	ATG	2	6	3098	3103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414562960
47	NC_017582	AAG	2	6	3125	3130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414562960
48	NC_017582	TTA	2	6	3315	3320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414562960
49	NC_017582	TCT	2	6	3394	3399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414562960
50	NC_017582	TGT	2	6	3405	3410	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414562960
51	NC_017582	TTG	2	6	3425	3430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414562960
52	NC_017582	CAG	2	6	3557	3562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414562961
53	NC_017582	GCT	2	6	3631	3636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414562961
54	NC_017582	TGGTA	2	10	3669	3678	20 %	40 %	40 %	0 %	414562961
55	NC_017582	A	7	7	3727	3733	100 %	0 %	0 %	0 %	414562961
56	NC_017582	TGT	2	6	3852	3857	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414562961
57	NC_017582	TGA	3	9	3867	3875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414562961
58	NC_017582	AATT	2	8	3950	3957	50 %	50 %	0 %	0 %	414562961
59	NC_017582	AATC	2	8	3971	3978	50 %	25 %	0 %	25 %	414562961
60	NC_017582	A	6	6	4001	4006	100 %	0 %	0 %	0 %	414562961
61	NC_017582	A	6	6	4058	4063	100 %	0 %	0 %	0 %	414562961
62	NC_017582	GAA	2	6	4078	4083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414562961
63	NC_017582	GAT	2	6	4114	4119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414562961
64	NC_017582	A	6	6	4124	4129	100 %	0 %	0 %	0 %	414562961
65	NC_017582	TTA	2	6	4147	4152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414562961
66	NC_017582	TGA	2	6	4185	4190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414562961
67	NC_017582	GCA	2	6	4246	4251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414562961
68	NC_017582	GTT	2	6	4267	4272	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414562961
69	NC_017582	AGA	3	9	4290	4298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414562961
70	NC_017582	GAT	2	6	4312	4317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414562961
71	NC_017582	ACTTGG	2	12	4398	4409	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	414562961
72	NC_017582	GTGC	2	8	4438	4445	0 %	25 %	50 %	25 %	414562961
73	NC_017582	CAC	2	6	4472	4477	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	414562961
74	NC_017582	AGC	2	6	4479	4484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414562961
75	NC_017582	ATG	2	6	4541	4546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414562961
76	NC_017582	GTC	2	6	4589	4594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414562961
77	NC_017582	AGGA	2	8	4601	4608	50 %	0 %	50 %	0 %	414562961
78	NC_017582	AT	3	6	4614	4619	50 %	50 %	0 %	0 %	414562961
79	NC_017582	CAAA	2	8	4869	4876	75 %	0 %	0 %	25 %	414562962
80	NC_017582	AGA	2	6	4937	4942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414562962
81	NC_017582	TTG	2	6	4960	4965	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414562962
82	NC_017582	ATCA	2	8	4977	4984	50 %	25 %	0 %	25 %	414562962
83	NC_017582	ATTT	2	8	4992	4999	25 %	75 %	0 %	0 %	414562962
84	NC_017582	AAT	2	6	5022	5027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414562962
85	NC_017582	ATG	2	6	5095	5100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414562962
86	NC_017582	G	6	6	5151	5156	0 %	0 %	100 %	0 %	414562962
87	NC_017582	ATT	2	6	5175	5180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414562962
88	NC_017582	TTA	2	6	5251	5256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414562962
89	NC_017582	GAT	2	6	5283	5288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414562962
90	NC_017582	CAAT	2	8	5296	5303	50 %	25 %	0 %	25 %	414562962
91	NC_017582	TAT	2	6	5337	5342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414562962
92	NC_017582	A	6	6	5350	5355	100 %	0 %	0 %	0 %	414562962
93	NC_017582	GCA	2	6	5372	5377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414562962
94	NC_017582	ATT	2	6	5407	5412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414562963
95	NC_017582	AGC	3	9	5500	5508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414562963
96	NC_017582	GTG	2	6	5549	5554	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414562963
97	NC_017582	CTTG	2	8	5602	5609	0 %	50 %	25 %	25 %	414562963
98	NC_017582	T	6	6	5630	5635	0 %	100 %	0 %	0 %	414562963
99	NC_017582	GAT	2	6	5639	5644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414562963
100	NC_017582	CTG	2	6	5646	5651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414562963
101	NC_017582	T	6	6	5710	5715	0 %	100 %	0 %	0 %	414562963
102	NC_017582	TTAGC	2	10	5748	5757	20 %	40 %	20 %	20 %	414562963
103	NC_017582	CAG	2	6	5795	5800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414562963
104	NC_017582	AAG	2	6	5852	5857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414562963
105	NC_017582	GTT	2	6	5891	5896	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414562963
106	NC_017582	T	6	6	5975	5980	0 %	100 %	0 %	0 %	414562963
107	NC_017582	TGA	2	6	5983	5988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414562963
108	NC_017582	TC	3	6	6029	6034	0 %	50 %	0 %	50 %	414562963
109	NC_017582	AGGA	2	8	6038	6045	50 %	0 %	50 %	0 %	414562963
110	NC_017582	GTGAT	2	10	6069	6078	20 %	40 %	40 %	0 %	414562963
111	NC_017582	GGA	2	6	6088	6093	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	414562963
112	NC_017582	CAGCTT	2	12	6125	6136	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	414562963
113	NC_017582	GGA	2	6	6163	6168	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	414562963
114	NC_017582	GCT	2	6	6169	6174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414562963
115	NC_017582	TAA	2	6	6180	6185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414562963
116	NC_017582	AAG	2	6	6186	6191	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414562963
117	NC_017582	AATG	2	8	6239	6246	50 %	25 %	25 %	0 %	414562963
118	NC_017582	T	6	6	6284	6289	0 %	100 %	0 %	0 %	414562963
119	NC_017582	GAT	2	6	6290	6295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414562963
120	NC_017582	AGTT	2	8	6303	6310	25 %	50 %	25 %	0 %	414562963
121	NC_017582	TTG	2	6	6347	6352	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414562963
122	NC_017582	GAT	2	6	6356	6361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414562963
123	NC_017582	ACA	2	6	6364	6369	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414562963
124	NC_017582	ATT	2	6	6393	6398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414562963
125	NC_017582	CTT	2	6	6442	6447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414562963
126	NC_017582	TCAA	2	8	6528	6535	50 %	25 %	0 %	25 %	414562963
127	NC_017582	TGA	2	6	6550	6555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414562963
128	NC_017582	TCA	2	6	6607	6612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414562963
129	NC_017582	CTG	2	6	6672	6677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414562963
130	NC_017582	ATT	2	6	6707	6712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414562963
131	NC_017582	TGA	2	6	6742	6747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414562963
132	NC_017582	AT	3	6	6776	6781	50 %	50 %	0 %	0 %	414562963
133	NC_017582	CGT	2	6	6797	6802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414562963
134	NC_017582	TCG	2	6	6805	6810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414562963
135	NC_017582	T	6	6	6901	6906	0 %	100 %	0 %	0 %	414562963
136	NC_017582	CAG	2	6	6965	6970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414562963
137	NC_017582	CAG	2	6	7026	7031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414562963
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139	NC_017582	AGCAA	2	10	7081	7090	60 %	0 %	20 %	20 %	414562963
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143	NC_017582	GCT	2	6	7346	7351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414562963
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147	NC_017582	A	6	6	7522	7527	100 %	0 %	0 %	0 %	414562963
148	NC_017582	ATT	3	9	7541	7549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414562963
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156	NC_017582	AAG	2	6	7895	7900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414562963
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159	NC_017582	TAT	2	6	8032	8037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414562963
160	NC_017582	TGCCTA	2	12	8152	8163	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	414562963
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249	NC_017582	ATT	2	6	13200	13205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414562968
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251	NC_017582	TGA	2	6	13246	13251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414562968
252	NC_017582	CAT	2	6	13261	13266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414562968
253	NC_017582	GAC	2	6	13269	13274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414562968
254	NC_017582	A	7	7	13343	13349	100 %	0 %	0 %	0 %	414562968
255	NC_017582	CAGG	3	12	13510	13521	25 %	0 %	50 %	25 %	414562968
256	NC_017582	A	7	7	13549	13555	100 %	0 %	0 %	0 %	414562968
257	NC_017582	AGC	2	6	13593	13598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414562968
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259	NC_017582	TGGT	2	8	13647	13654	0 %	50 %	50 %	0 %	414562968
260	NC_017582	A	6	6	13725	13730	100 %	0 %	0 %	0 %	414562968
261	NC_017582	A	6	6	13759	13764	100 %	0 %	0 %	0 %	414562969
262	NC_017582	ATT	2	6	13785	13790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414562969
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